{"id":31877,"date":"2022-10-10T20:15:00","date_gmt":"2022-10-10T19:15:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/?p=31877"},"modified":"2022-10-10T22:44:28","modified_gmt":"2022-10-10T21:44:28","slug":"longseq-resuelve-casos-geneticos-complejos-con-tecnologia-disruptiva","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/es\/longseq-resuelve-casos-geneticos-complejos-con-tecnologia-disruptiva\/","title":{"rendered":"Longseq resuelve casos gen\u00e9ticos complejos con tecnolog\u00eda disruptiva."},"content":{"rendered":"<h2>La startup ha innovado en c\u00f3mo estudiar el genoma de cualquier organismo y ofrece soluciones en medicina de precisi\u00f3n, en especial para enfermedades raras, industria alimentaria y agricultura, entre otros campos.<\/h2>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Longseq Aplications ofrece servicios de una t\u00e9cnica gen\u00e9tica de \u00faltima generaci\u00f3n<\/strong>, <strong>la secuenciaci\u00f3n de cadenas extralargas por nanoporos<\/strong>, q<strong>ue permite resolver casos gen\u00e9ticos complejos y que las t\u00e9cnicas convencionales no son capaces de hacerlo.<\/strong> Su propuesta va desde la secuenciaci\u00f3n en el laboratorio hasta el an\u00e1lisis de datos final, con una atenci\u00f3n personalizada.<\/p>\n<p>La <strong>I+D+i se respira en todo su proceso de trabajo<\/strong>. Este compromiso ha sido clave para obtener la <strong>certificaci\u00f3n como Empresa Innovadora de Base Tecnol\u00f3gica (EIBT) que otorga ANCES y gestiona el Centro Europeo de Empresas e Innovaci\u00f3n de Murcia (CEEIM).<\/strong><\/p>\n<blockquote><p>\u201cLa t\u00e9cnica de<strong> secuenciaci\u00f3n masiva de tercera generaci\u00f3n por nanoporos<\/strong> ofrece una manera <strong>nueva de estudiar el genoma de cualquier organismo, a partir de ADN o ARN sin necesidad de manipular y en tiempo real.<\/strong> Adem\u00e1s nosotros implementamos pipelines inform\u00e1ticas y procesos de laboratorio propios a los que aplicamos esta t\u00e9cnica de secuenciaci\u00f3n\u201d, indica <strong>Bel\u00e9n de la Morena Barrio, CEO de la empresa<\/strong>.<\/p><\/blockquote>\n<p>Detr\u00e1s del \u201cnosotros\u201d hay un <strong>equipo multidisciplinar de profesionales<\/strong> que crearon en 2020 una empresa, a partir de una spin off de la Universidad de Murcia y <strong>une a los grupos de investigaci\u00f3n de oncohematolog\u00eda, Inform\u00e1tica de la Universidad de Murcia e Inform\u00e1tica del Instituto Murciano de Investigaci\u00f3n Biosanitaria Virgen de la Arrixaca (IMIB-Arrixaca)<\/strong>.<\/p>\n<p>Con s\u00f3lo unos meses en el mercado, m\u00e9dicos e investigadores del campo de la salud y de gen\u00e9tica, al igual que de agroalimentaci\u00f3n en Espa\u00f1a y B\u00e9lgica ya conocen sus servicios.<\/p>\n<p>Bel\u00e9n anima a <strong>quienes est\u00e9n pensando en emprender a ir adelante con su idea y rodearse de personas que puedan guiarle e impulsarle, con son CEEIM, la Universidad y el INFO.<\/strong> \u201dEstamos muy agradecidos por el apoyo que estamos recibiendo\u201d, remarca por su parte.<\/p>\n<h3>Entrevista<\/h3>\n<p><strong>Pregunta (P): \u00bfQu\u00e9 ventajas aporta vuestro servicio innovador a los clientes?<\/strong><\/p>\n<p><strong>Respuesta (R):<\/strong> Esta reciente tecnolog\u00eda y nuestro servicio de an\u00e1lisis de datos aportan <strong>nuevos resultados en casos en los que las t\u00e9cnicas convencionales no pueden dar respuesta.<\/strong><\/p>\n<p>Adem\u00e1s, algunas de las aplicaciones que ofrecemos tambi\u00e9n <strong>permiten integrar muchos datos y resultados en procesos m\u00e1s sencillos y econ\u00f3micos.<\/strong><\/p>\n<h3>Singularidad<\/h3>\n<p><strong>P: \u00bfQu\u00e9 necesidad detectasteis en el mercado, cuando decidisteis emprender? <\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> El origen de esta EIBT surge de un problema que nos encontr\u00e1bamos en nuestro laboratorio, directamente relacionado con mi tesis doctoral.<\/p>\n<p>En este trabajo de investigaci\u00f3n in\u00e9dito, <strong>investig\u00e1bamos la base gen\u00e9tica de pacientes con una enfermedad rara que aumenta el riesgo de trombosis, la \u201cdeficiencia de antitrombina\u201d.<\/strong><\/p>\n<p>Ten\u00edamos un 20% de pacientes sin base molecular conocida, tras haber aplicado toda la tecnolog\u00eda desarrollada hasta la fecha.<\/p>\n<p><strong>Para esos casos en los que se ha aplicado todas las t\u00e9cnicas gen\u00e9ticas disponibles, hab\u00eda que buscar una soluci\u00f3n nueva.<\/strong><\/p>\n<p>Para ello, implementamos en nuestro laboratorio una tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n de \u00faltima generaci\u00f3n, la secuenciaci\u00f3n por nanoporos. Me form\u00e9 en ella durante mi estancia en la <strong>Universidad de Cambridge<\/strong>.<\/p>\n<p>Al aplicar esta tecnolog\u00eda a nuestros pacientes sin base gen\u00e9tica conocida, conseguimos diagnosticar tres casos, detectando un nuevo mecanismo implicado en esta patolog\u00eda, la inserci\u00f3n de un retrotransposon.<\/p>\n<p>Esto, junto con otras aplicaciones que <strong>hemos ido desarrollando de esta t\u00e9cnica, aplicables a otras patolog\u00edas y otras \u00e1reas<\/strong>, quisimos ponerlo al servicio de otros investigadores y m\u00e9dicos para su aplicaci\u00f3n por medio de esta EIBT.<\/p>\n<h3>Indagar<\/h3>\n<p><strong>P: \u00bfY c\u00f3mo surge vuestro inter\u00e9s por la innovaci\u00f3n?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R: <\/strong>Por la motivaci\u00f3n de l<strong>a b\u00fasqueda de nueva tecnolog\u00eda que pueda solucionar problemas o inc\u00f3gnitas no resueltas<\/strong>, con lo que hay disponible hoy en d\u00eda. En concreto, en nuestra \u00e1rea, <strong>lo busc\u00e1bamos en la resoluci\u00f3n de casos de enfermedad de base gen\u00e9tica desconocida.<\/strong><\/p>\n<p>Una vez encontrada esa nueva soluci\u00f3n, la principal motivaci\u00f3n para trasladarla por medio de la empresa era dar salida al trabajo desarrollado en nuestro laboratorio a otros investigadores y empresas. <strong>Quer\u00edamos ofrecer este servicio integral a la sociedad de una manera m\u00e1s directa, a trav\u00e9s de una empresa.<\/strong><\/p>\n<p>Decidimos emprender porque ve\u00edamos que cont\u00e1bamos con un buen equipo y una tecnolog\u00eda con un gran potencial en numerosos campos.<\/p>\n<p><strong>P: \u00bfQu\u00e9 novedades tecnol\u00f3gicas aport\u00e1is en vuestro producto?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R: <\/strong>Debido a la novedad de la t\u00e9cnica, <strong>existen hoy en d\u00eda pocas empresas proveedoras de servicios de nanoporos<\/strong>. En Espa\u00f1a, s\u00f3lo existe una empresa los ofrezca.<\/p>\n<p>Adem\u00e1s, estas empresas suelen ofrecer s\u00f3lo los resultados crudos. Nosotros, no s\u00f3lo contamos con un equipo experto en la tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n por nanoporos, sino que, adem\u00e1s, contamos con especialistas en biolog\u00eda molecular, bioinform\u00e1ticos y m\u00e9dicos, farmac\u00e9uticos, as\u00ed como t\u00e9cnicos e inform\u00e1ticos.<\/p>\n<p><strong>Este equipo multidisciplinar nos permite recopilar, analizar y procesar, as\u00ed como interpretar los datos para ofrecer un asesoramiento completo de los resultados derivados de los an\u00e1lisis y ofrecer un servicio integral al cliente.<\/strong><\/p>\n<p>Nuestros servicios van desde la propia <strong>secuenciaci\u00f3n de la muestra en el laboratorio<\/strong>, pasan por el <strong>an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico e interpretaci\u00f3n biol\u00f3gica y cl\u00ednica<\/strong> -con excelentes resultados en la identificaci\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de variantes estructurales- <strong>hasta aplicaciones espec\u00edficas que ofrecen estas t\u00e9cnicas,<\/strong> <strong>implementando nuevas aproximaciones desarrolladas internamente desde nuestro laboratorio.<\/strong><\/p>\n<p><strong>P: La tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n por nanoporos ya exist\u00eda. \u00bfC\u00f3mo hab\u00e9is innovado a partir de ella?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Es una tecnolog\u00eda propia de la multinacional <strong>Oxford Nanopore Technologies<\/strong>, que vende los equipamientos y los reactivos, pero que no ofrece el servicio de los mismos.<\/p>\n<p>Nosotros hemos desarrollado aplicaciones y soluciones mediante estas t\u00e9cnicas, como es un <strong>servicio integral desde la recepci\u00f3n de la muestra hasta la obtenci\u00f3n de los datos pipelines propias de an\u00e1lisis inform\u00e1tico<\/strong>. Al ser un equipo ligado a la investigaci\u00f3n, estamos en continuo desarrollo e innovaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Las nuevas aplicaciones que desarrollamos en el laboratorio, las ponemos al servicio del cliente.<\/p>\n<div id=\"attachment_31894\" style=\"width: 245px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-31894\" class=\"size-medium wp-image-31894\" src=\"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/wp-content\/uploads\/2022\/10\/Belen-de-la-Morena-Barrio-CEO-de-la-empresa.-235x300.png\" alt=\"Belen-de-la-Morena-Barrio-CEO-de-la-empresa\" width=\"235\" height=\"300\" srcset=\"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/wp-content\/uploads\/2022\/10\/Belen-de-la-Morena-Barrio-CEO-de-la-empresa.-235x300.png 235w, https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/wp-content\/uploads\/2022\/10\/Belen-de-la-Morena-Barrio-CEO-de-la-empresa..png 446w\" sizes=\"(max-width: 235px) 100vw, 235px\" \/><p id=\"caption-attachment-31894\" class=\"wp-caption-text\">Bel\u00e9n de la Morena Barrio, CEO de la empresa.<\/p><\/div>\n<h3>Servicios<\/h3>\n<p><strong>P: \u00bfCu\u00e1les son vuestras propuestas estrellas?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Los servicios disponibles se dividen en cinco \u00e1reas.<\/p>\n<p><strong>Secuenciaci\u00f3n del genoma completo, \u201cGenomic\u201d<\/strong>, sobre secuencia el ADN sin ninguna manipulaci\u00f3n, lo que permite la obtenci\u00f3n de lecturas largas y el estudio de metilaci\u00f3n del material gen\u00e9tico.<\/p>\n<p><strong>Secuenciaci\u00f3n dirigida por PCR largas, \u201cTargeted region PCR\u201d<\/strong>, secuencia una regi\u00f3n espec\u00edfica que se ha amplificado mediante PCR.<\/p>\n<p><strong>Secuenciaci\u00f3n dirigida por enriquecimiento, \u201cTargeted regi\u00f3n (enrichment)<\/strong>. Estudia ADN sin manipular, dirigido a una regi\u00f3n especifica de un tama\u00f1o de 3 Mb.<\/p>\n<p><strong>RNA, \u201cRNAseq\u201d. Secuencia ARN directamente,<\/strong> sin manipular, permitiendo estudiar transcritos completos y epitranscript\u00f3mica.<\/p>\n<p><strong>Metagen\u00f3mica, \u201cMetagenomics 16S\u201d.<\/strong> Para el estudio del microbioma<\/p>\n<p>Estos productos reportan ventajas con respecto a las t\u00e9cnicas que pueden usar los futuros clientes con respecto a las t\u00e9cnicas anteriores, ya que pueden aportar nuevos resultados.<\/p>\n<p><strong>P: \u00bfY qu\u00e9 hay detr\u00e1s de esto resultados novedosos?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Detr\u00e1s est\u00e1n la detecci\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de variantes estructurales, estudios de epigen\u00e9ticos o estudios de tr\u00e1nscritos alternativos no dectados por otras t\u00e9cnicas hasta ahora. Al igual que estudios de haplotipado que defina el origen de las especies o mutaciones bialelicas en menor tiempo y coste que t\u00e9cnicas anteriores o estudio de microbiomas de manera m\u00e1s r\u00e1pida y barata que en t\u00e9cnicas anteriores.<\/p>\n<h3>Mercado<\/h3>\n<p><strong>P: \u00bfC\u00f3mo est\u00e1 siendo vuestra fase de comercializaci\u00f3n?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Ya hemos facturado en los meses que llevamos en marcha. <strong>Tenemos clientes de grupos de investigaci\u00f3n de Murcia, Granada, B\u00e9lgica, Madrid y Barcelona. S<\/strong>e trata de m\u00e9dicos e investigadores del campo de la salud, de la gen\u00e9tica y del campo de agroalimentaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Nuestro equipo, al estar, principalmente, dedicado a la investigaci\u00f3n en el campo de la salud, en concreto de Hematolog\u00eda y Oncolog\u00eda, nos permite dirigirnos primero al mercado m\u00e1s cercano, que son los grupos de investigaci\u00f3n afines. Tambi\u00e9n contactamos a trav\u00e9s de foros y entornos conocidos.<\/p>\n<p>Actualmente queremos ampliar el alcance, que es lo que m\u00e1s nos cuesta, para llegar a campos tan interesantes como el agroalimentario, al que esta tecnolog\u00eda puede ser muy \u00fatil.<\/p>\n<p><strong>P: Las empresas con alto grado de innovaci\u00f3n y tecnolog\u00eda precisan equipos altamente cualificados. Actualmente \u00bfCu\u00e1ntas personas est\u00e1is involucradas en vuestro desarrollo y qu\u00e9 formaci\u00f3n tiene?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R: <\/strong>El perfil que compone nuestra empresa es principalmente del campo cient\u00edfico y es multidisciplinar. Contamos con m\u00e9dicos, doctores, bi\u00f3logos, t\u00e9cnicos especialistas en biolog\u00eda molecular, inform\u00e1ticos y bioinform\u00e1ticos<\/p>\n<p><strong>P: \u00bfC\u00f3mo es el cliente potencial de vuestros servicios?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R: <\/strong>Es variado, ya que son de inter\u00e9s para <strong>m\u00e9dicos de enfermedades raras de base gen\u00e9tica o de c\u00e1ncer hereditario<\/strong>, con casos de pacientes sin diagn\u00f3stico gen\u00e9tico,tras estudios por NGS. Asimismo, <strong>grupos de investigaci\u00f3n del transcriptoma y epitranscriptoma<\/strong> que otras t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n no ofrecen.<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n nos dirigimos a investigadores b\u00e1sicos del campo de la biolog\u00eda o de biotecnolog\u00eda para el estudio de organismos m\u00e1s peque\u00f1os, a los departamentos de I+D de industrias alimentarias para analizar el origen de las especies y a pharma andbBiotech Companies, para estudios de medicina personalizada. E incluso, a los clinical laboratories para el seguimiento de pacientes.<\/p>\n<p><strong>P: \u00bfQu\u00e9 consejo le dar\u00eda a una persona que est\u00e1 dudando en emprender?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Le dir\u00eda que, si viene del mundo cient\u00edfico o tecnol\u00f3gico,<strong> se apoye en el ecosistema emprendedor que existe en la Regi\u00f3n<\/strong>, especialmente del CEEIM, la Universidad y el INFO. Para nosotros est\u00e1 siendo clave y estamos muy agradecidos por todo el apoyo que estamos recibiendo de ellos.<\/p>\n<p><strong>P: Entre los hitos alcanzados durante la trayectoria, \u00bfCu\u00e1les destacar\u00edas?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R: <\/strong>Primero, la <strong>constituci\u00f3n de la empresa<\/strong>, que es el paso m\u00e1s importante y no fue nada sencillo porque nos pill\u00f3 en plena emergencia sanitaria, con todo lo que ello supuso.<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n, haber sido capaz de <strong>adentrarnos en el mundo de la empresa,<\/strong> siendo investigadores b\u00e1sicos. \u00c9ste ha sido un reto del que hemos aprendido y nos ha enriquecido mucho.<\/p>\n<h3>Reconocimientos<\/h3>\n<p>Despu\u00e9s, tambi\u00e9n nos ha sorprendido la <strong>buena acogida que ha tenido nuestro proyecto<\/strong> por distintas entidades <strong>y los premios concedidos<\/strong>, donde est\u00e1n el Premio VII CIM-C\u00e1tedra de emprendedores de la Universidad de Murcia al mejor proyecto de creaci\u00f3n de una empresa; el Premio al mejor proyecto y Premio Talento UMU emprende III Edici\u00f3n.<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n obtuvimos el acc\u00e9sit a la mejor idea para la creaci\u00f3n de una empresa. Categor\u00eda IV, el Premio Emprendedor del mes de Abril y el Premio Acc\u00e9sit al mejor proyecto empresarial por el Ayuntamiento de Murcia.<\/p>\n<p>Por \u00faltimo, destacar\u00eda que, gracias a <strong>tener esta EIBT, hemos podido obtener distintos proyectos de investigaci\u00f3n de gran nivel,<\/strong> como es un proyecto de medicina personalizada concedido por el Instituto de Salud Carlos III, de casi 800.000\u20ac, que aborda la investigaci\u00f3n de pacientes con distintas patolog\u00edas con base gen\u00e9tica desconocida. Todos estos proyectos se desarrollar\u00e1n en los pr\u00f3ximos 4 a\u00f1os.<\/p>\n<p><strong>P: \u00bfCu\u00e1les son vuestros planes de futuro?<\/strong><\/p>\n<p>Nuestro plan es ir creciendo, incorporando el perfil de empresa que nos falta para <strong>dar un salto de profesionalizaci\u00f3n<\/strong> que necesitamos en <strong><a href=\"https:\/\/www.longseq.com\/\">Longseq<\/a><\/strong>.<\/p>\n<p><strong>P: Como emprendedora, \u00bfD\u00f3nde te ves dentro de 10 a\u00f1os?<\/strong><\/p>\n<p><strong>R:<\/strong> Lo ideal como emprendedora de esta EIBT ser\u00eda estar en la empresa, consolidada, generando riqueza en forma de contrataci\u00f3n de personal y de avance cient\u00edfico e industrial, a trav\u00e9s de los servicios que prestemos a nuestros clientes.<\/p>\n<p>Me gustar\u00eda poder consolidar ese perfil, de la mano de la universidad, siendo, investigadora, emprendedora y docente para poder enriquecer mi carrera profesional y aportar a la sociedad tanto conocimiento como productos o servicios que puedan mejorar nuestro entorno. Y, adem\u00e1s, transmitirlo as\u00ed a los futuros j\u00f3venes profesionales.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>+INFO sobre el sello EIBT<\/h3>\n<p class=\"entry_title\"><a href=\"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/es\/ceem-lleva-gestionados-ya-34-sellos-eibt-startups-tecnologicas\/\"><strong>CEEIM LLEVA GESTIONADOS YA 34 SELLOS EIBT DE STARTUPS TECNOL\u00d3GICAS.<\/strong><\/a><\/p>\n<p>La marca EIBT es un programa espec\u00edfico que ofrece CEEIM, a trav\u00e9s de\u00a0<a href=\"http:\/\/www.ances.com\/proyectos\/marca-eibt-empresa-innovadora-de-base-tecnologica\/\">ANCES, Asociaci\u00f3n Nacional de CEEI Espa\u00f1oles,<\/a>. Est\u00e1 pensado para las Empresas Innovadoras de Base Tecnol\u00f3gica que tienen como objeto ser distinguidas a nivel nacional como \u00abEIBT\u00bb.<\/p>\n<p>Si quieres obtener el certificado de Empresa Innovadora de Base Tecnol\u00f3gica de ANCES, como ha hecho\u00a0<strong><a href=\"https:\/\/keep-cool.es\/\">KEEPCOOL<\/a><\/strong>, entre en este enlace para obteneer m\u00e1s informaci\u00f3n:\u00a0<strong><a href=\"https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/es\/sello-eibt-ances\/\">https:\/\/www.ceeim.es\/archivo\/es\/sello-eibt-ances\/<\/a><\/strong><\/p>\n<p><strong>El plazo de inscripci\u00f3n de empresas est\u00e1 abierto hasta el pr\u00f3ximo 31 de octubre pr\u00f3ximo.<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La startup ha innovado en c\u00f3mo estudiar el genoma de cualquier organismo y ofrece soluciones en medicina de precisi\u00f3n, en especial para enfermedades raras, industria alimentaria y agricultura, entre otros campos. &nbsp; Longseq Aplications ofrece servicios de una t\u00e9cnica gen\u00e9tica de \u00faltima generaci\u00f3n, la secuenciaci\u00f3n de cadenas extralargas por nanoporos, que permite resolver casos gen\u00e9ticos complejos y que las t\u00e9cnicas convencionales no son capaces de hacerlo. 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